Ha due possibilità:
-  crei un disco dati: copi il file sul dvd come file mkv (codec matroska) senza convertirlo. se è largo 2,9 Gb non hai problemi a scriverlo. 
   Così non lo potrai riprodurre su apparecchi che non decodificano il codec.
- se tenti di convertirlo in qualsiasi formato diverso, non è detto che la conversione sia efficiente in termini di spazio. Se lo fai in divx dovresti scendere come taglia e la qualità potrebbe essere (anzi è) leggermente peggiore. Ma lo leggeresti poi su gran parte dei lettori capaci di leggere i divx.
Probabilmente hai tentato di creare un "disco video" e non un "disco dati", e il risultato della conversione nel formato scelto da nero (probabilmete avi)  veniva oltre i 4,7Gb...